A Controladoria do Instituto Bairral compreende os setores de Pessoal, Contabilidade, Contas a Pagar/Receber e Faturamento. Este complexo envolve 11 funcionários e uma coordenadora geral.
O setor de Pessoal gerencia as questões documentais e trabalhistas dos 790 funcionários, incluindo todas as rotinas inerentes, como admissões, demissões, folha de pagamento e administração de benefícios, entre outros. Recentemente, o setor de Pessoal passou a administrar o novo programa de ponto eletrônico, que prevê novas rotinas de conferência e registro dos horários trabalhados, conforme preconizado pela Portaria n.º 1.510, de 21.8.09, do Ministério do Trabalho e Emprego. O Faturamento encarrega-se da relação comercial com mais de 60 convênios de saúde parceiros do Instituto Bairral e responde também pela emissão de inúmeros relatórios e demais documentos necessários aos processos que vão desde a internação até a alta do paciente. São 820 leitos ativos, sendo 511 destinados ao Sistema Único de Saúde (SUS). Finalmente, os setores de Contabilidade e Contas a Pagar/Receber têm a incumbência do planejamento de todo fluxo de caixa, relações bancárias, emissões de declarações, prestação de contas e elaboração dos registros contábeis em rigoroso cumprimento à legislação pertinente. A Contabilidade zela ainda pelo processo de renovação do certificado de entidade filantrópica.
Toda Controladoria, pela natureza dos serviços que executa, possui ampla interface com os demais setores do hospital, sempre objetivando atendê-los com qualidade e precisão.
Recentemente teve suas instalações inteiramente reformadas, passando a apresentar novo lay-out e agregando beleza e maior funcionalidade.
